政治和领土争端已经渗透到了科学研究领域。 中国和东南亚国家在南海领土划分上存在争议,中国主张“南海九段线”,即包含西沙群岛和南沙群岛在内绝大部分南海属于中国,越南、菲律宾、文莱、马来西亚和台湾则各自主张它们拥有南海的一部分。南海被认为拥有蕴藏量丰富的矿物质,其中包括了大量石油。英国的《自然》杂志发表了一篇社论和一篇新闻报道,指出科学论文中附带的地图卷入了南海领土争端之中。中国科学家向《自然》、《科学》和《气候变化》等递交的论文中宣传了中国主张的南海九段线地图,引起了越南科学家的抗议,指责中国政府借助这种秘密的“后门”策略,利用著名科学期刊的名气合法化受争议的“南海九段线”。《科学》杂志表示它对于管辖权声明没有任何立场,表示会审议地图接受程序,确保未来不会出现为受争议的领土背书的情况。《气候变化》期刊编辑Michael Oppenheimer检查了一篇包含南海地图的论文,发现论文结论和地图没有任何关系,他建议论文主要作者、中国科学院地理科学与资源研究所的Xuemei Shao去除地图,Shao拒绝了,她在电子邮件中解释说地图是“中国政府的要求”。《自然》、《科学》和《气候变化》最后决定不从论文中移除引起争端的地图。一位科学家建议,地图应该像科学数据一样精确,在出版前需要核查。

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