面对大陆，马英九对中央社说，两岸关系改善时，中华民国的国际关系同时也改善，不一定要成為恶性循环，希望双方在国际上尽量减少不必要恶斗与内耗。现在政府所做所為，就是希望出现一种良性循环。
他指出， 大陆与台湾都有天主教徒，台湾对天主教有一份感恩之情，相信大陆上也是一样，这其实是人类非常崇高的感情，应尽量避免政治恶斗。
马英九表示，教廷是一个宗教国家，目的就是人道、慈善、济贫，这其实是普世价值，大陆也经常在做这样的工作。中华民国跟教廷关系，在实质上真的有蛮多互动，例如安排大陆神职人员到台湾参加讲习，希望大陆与教廷关系能改善。
马英九说，应朝这个方向推动，相信不论对两岸、对国际，应该都是正面的。他表示，以前不敢奢望能够有双赢、良性的循环，但将近5年一步一脚印地走下来，这种现象已开始逐渐出现，很希望这条路继续走下去，将来能够真正在两岸、在国际社会，也能够相互帮助、彼此扶持，这应该是两岸关系最高境界。
谈到在梵蒂冈的国际互动，马英九指出，像宏都拉斯总统、尼加拉瓜副总统都在现场，有一些虽然是无邦交国，但很也友善与他打招呼。例如坐他旁边的哥斯达黎加女总统，自然而然有很多话可以谈，而且这些人都是非常虔诚的天主教徒，对弥撒仪节蛮清楚的，他有时还请教对方这些代表什么意义，互动过程就是很自然。
至于和德国总理默克尔寒暄，马英九说，看到默克尔，他就去打招呼，自我介绍，也期许双方能够有机会多接触，谈话内容都是非常一般性的。也有人跟他打招呼，在现场还碰到老朋友西班牙王储。
谈到马英九与拜登的见面，和马英九同行的台湾国安会秘书长袁健生表示，拜登原来是参议员，在外交委员会很多年，后来担任主席，他刚好负责国会工作，拜登曾带队到过台湾，对台湾非常了解，因為拜登担任参议员时通过台湾关系法，所以拜登基本上是老朋友。
马英九也说，袁健生当年在美国工作时，认识了拜登，也不知道哪一天会来这种场合，因為袁健生与拜登熟识，老远就看到拜登，自然就过去打招呼，就是这样而已。
马英九说，最近这两年美方高层来访蛮多，台湾与美国关系也有成长，当然他有一些期许，例如台美贸易暨投资架构协定（TIFA）协商，他昨天有向拜登提到TIFA，也提到民主党上任后核准了两批对台军售，同时也给台湾免签证待遇。
马英九表示，总之谈的就是两国关系间一些非常正面的事情，一方面感谢对方，另一方面也表示希望继续维持这样的关系。这与他接见其他来访的美国政要所谈内容都差不多，只不过他过去不认识拜登，这是第一次见面。
面对台湾岛内舆论，马英九对这次梵蒂冈之行做了总结。他说，这是台湾外交部长期努力的结果，不是因為他跑这一趟就怎么样，「外交上没有奇迹的，一定是长期努力，慢慢一点一滴的累积」，所以有时候在累积过程中看不出来有什么了不起，可是可能到某一个时间，条件成熟的时候，就会发生很大的力量。马英九表示，这次驻教廷大使馆鍥而不捨地再努力，他非常肯定台湾驻教廷大使王豫元。他认為，政府都一直默默耕耘，就像昨天到就职弥撒现场后，看到一些老朋友，这都是过去外交部邀请来台湾的，当时也许不是知名人士，可是长期累积下来，到适当时机后，就会变成中华民国的助力。
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