在本拉登的遗体海葬后，伊斯兰逊尼派最高宗教当局发言人表示，伊斯兰教反对海葬仪式。美军在巴基斯坦展开猎杀本拉登的军事行动前，没有事先通报伊斯兰堡可能会引发主权争议。
在盖达基地组织（Al-Qaeda）领导人本拉登的遗体海葬后，埃及爱资哈尔清真寺（Al Azhar）周一在声明中表示，如果海葬消息属实，那大伊玛目塔伊布（Sheikh Ahmed al-Taïeb）对此谴责。法新社指出，设在开罗的爱资哈尔清真寺被认为是伊斯兰逊尼派（Sunnite）最高宗教权力机构。
据介绍，爱资哈尔清真寺的大伊玛目塔伊布（Sheikh Ahmed al-Taïeb）的顾问阿萨波说：海葬的做法违反宗教和人权价值观念。伊斯兰禁止破坏遗体，不论死者的信仰，都应埋葬。伊斯兰律师（al zayat）认为，本拉登应该葬在他的出生地沙特阿拉伯。
另外，美军本次猎杀盖达组织领袖本拉登的行动保密到家，连巴基斯坦政府事先也不知情。有报道说，有关这项突击行动，奥巴马政府没有与包括巴基斯坦在内的其他国家分享情报。奥巴马政府在突击行动结束后，才向巴基斯坦当局正式报告成果。当事国政府被蒙在鼓里的状况，可能会引发有关侵犯主权的争议。
据介绍，美国中央情报局（CIA）花费多年想要找到盖达组织首脑本拉登的藏身处。凭藉一名受本拉登信赖的信使找到他后，特种部队花了40分钟，就让这名信使与本拉登一同毙命。
英国《卫报》（Guardian）发自华盛顿的报导指出，过去十年，各界一直猜测本拉登藏身於巴基斯坦偏远部落地区，或躲在阿富汗边界，但最后却发现他就住在巴基斯坦首都伊斯兰堡（Islamabad）的富裕郊区。
美国高阶官员在深夜视讯新闻简报中表示，911事件后，CIA追踪有关本拉登核心集团的各种线索，尤其是他的信使。其中一名信使尤其受到本拉登信赖，引起CIA特别关注。落网的激进分子都以假名称呼这名信使。起初无法查明这名信使的身分，最后终于在4年前锁定他。CIA于2年前发现这名信使及其兄弟在巴基斯坦住所的大致位置。更令他们起疑的是，这对兄弟并无明确收入来源。CIA发现有一个家族和这对兄弟住在一起，且符合本拉登家族的特徵。
去年8月，CIA范围缩小到位于伊斯兰马巴德以北一处富裕社区的一所宅第。他们发现那是一个不寻常的住所，围墙高约4到6公尺，上头还有带刺铁丝网，出入受到严格管制。主建筑物很少窗户。一所宅第推估价值约100万美元，却没有电话或网路连线，显然是专为恐怖分子打造的藏身处所。
CIA今年2月深信那就是本拉登的可能藏身地点；到了3月，美国总统奥巴马连续主持5次国家安全会议，在4月28日的最后1次会议后第二天，奥巴马下令展开突击。据说，本拉登曾做抵抗，在交火中被击毙。
