当天下午，该事件已基本平息，官方也于当天上午发布公告称“永远取消有关王子制纸排海工程项目”。中国官方随后派出了数千名武警在当地维持秩序，中共中宣部也严令召回了在当地采访的全部国内记者，并严禁相关反思性报道。
本台记者获得的一份全国政协委员潘庆林在2005年初向温家宝总理的呈文中，他对日本造纸巨头王子制纸在南通的这个号称投资20亿美金的造纸基地的环保问题提出了质疑。
潘庆林曾留日学习，对日本政商颇为熟悉。
在函中潘庆林说，造纸行业是纯资源消耗，加上水污染、空气污染，在日本这个处处干净的国家，已经很不受到欢迎，几年前，王子制纸就着手推行就近（为了日本方便用纸）移向中国的策略。
据说，当时由于江苏地方政府违规批复工厂，被中央制止，现在，王子又多次派出诸多要人到中国进行访问，并通过国内各种途径打通关节，进行全方位游说。
他呼吁温家宝和国务院慎重对待审批这一项目，权威资料显示，2005年4月份温家宝批示要求，“发改委查告”，该文也转呈时任发改委主任的张平办理。
从后来项目审批推进来看，很难推断，潘庆林的这一呈文和温家宝的批示，对该项目是否有实质性的阻碍和延缓。
但事实是，南通王子造纸的项目在去年就已经投产，而目前的中水排放口设置在长江，正在上海目前自来水的主要取水口长兴岛青草沙水库的上游。
或者可以理解为对温家宝批示的一种交待，王子制纸规划了环保配套项目，污水“排海工程”。
这一项目从南通厂区出发，贯穿了整个启东，目标以把造纸厂的废水，通过上百公里的管道，排放到到启东塘芦港外海，这里是启东的吕四渔港所在地，自然引起了渔民和启东市民们的不满。
但客观的说，相对长江口来说，外海环境容量更大，相对更为环保。某种程度上，激怒保护家园这一无可厚非的诉求出发的启东市民，正是这一环保工程。
而这一项目在启东民众压力下的“永远取消”，事实上，使长江中下游流域区域环评缺失下，大规模工业发展带来的污染乱象进一步凸显。
事实上，有许多环保业内人士相信，相对于王子制纸这样的大型造纸工厂，遍布长三角的中小型造纸上，单位产品的污染更加严重，而且更加难以规范和管制。
《第一财经日报》的一篇报道描述了长三角一家小型造纸厂水处理的现状。
造纸厂的正规排污渠道只有一个，当地政府目前实行的是在线监控，也就是政府规定的在线排放口。排污环节中可以做的手脚很明白：“加暗排口，也就是偷排，绕过在线监测的排放口，偷排污水。”
以前管得松，偷排污水很普遍，但从去年开始严查了。他们厂里的偷排污水通道已经被封，被罚的款额也让他们意识到，作为污水量不高的小型造纸厂，偷排的利益算上被罚款的风险几乎为负。再加上处理污水的成本因为量小也并不算太高，所以偷排污水就没了动力。
2011年，这家工厂一共交了2.5万多元排污费。在当年大约200万的利润中，排污成本估计是5万。
中国的环保法规规定，造纸厂生产出的污水必须经过二次处理，达标后才能排入江河湖海。
类似的大小造纸厂，正在日夜排出经过处理的污水，这些污水如果达到了国家排放标准，就被称为中水。
清华大学化学工程系膜材料与工程中心教授王晓琳认为，企业说的中水有时候很可能是处理过后仍不达标的污水，并非真正意义上达了标的中水。
王晓琳说：“处理成合格达标的中水并不需要特别的先进技术，都是些常规的技术，一般造纸厂都可以做到。关键是要花钱，是费用上的问题。”
王晓琳进一步举例，比如江浙一带的精细化工厂，要将一吨污水处理成达标的中水，可能需要花费几十元甚至上百元的高昂费用，这可能是中小企业目前的利润水平所无法承担的。
事实上，即便是处理达标的中水排放，也有一个环境容量的问题。具体到对启东事件来说，一个很大的悖论是排江还是排海。
虽然人人痛恨污水，但现实是在现代工业经济环境下，工业废水是我们生活环境的一部分，我们必须与污水共处。
当污染物进入水体，通过物理、化学和生物作用，使污水中污染物的浓度得以降低，经过一段时间后，水体往往能恢复到受污染前的状态，这就是水体自净。流速、流量越大，水的自净能力越强，因此，海洋的自净能力必然大于一般的江河。
国家海洋局发布的《2011年中国海洋环境状况公报》指出，陆源排污仍是影响海洋的主要原因。
江苏、上海、浙江、福建所在的东海海域，59%的入海排污口邻近海域环境质量受到排污较重或严重影响；山东青岛88%的入海排污口邻近海域不能满足所处海域的海洋功能区要求，环境质量受到污染影响。
上海海洋局副局长朱石清认为，污水排海只是现阶段的一种过渡的办法，想要治理污染，根本措施还是从源头上收集污染源，并提高污水处理厂的处理程度。
但无论是收集污染源还是提高污水处理厂处理程度，都需要花费大量的投资。同时往往还涉及拆迁、交通等市政问题。
当然，并非所有的污水都提倡排向海洋，毕竟海洋的环境容量也是有限的。尤其在环境敏感的海域，比如，在启东海域，就有知名的吕四渔港，启东海岸线上还有大量的海洋养殖分布，这里富饶的渔获，养活了沿岸的许多渔民，他们当然不愿成为污染的牺牲品。
他们的诉求也有依据。根据《中华人民共和国海洋环境保护法》第三十条规定，在海洋自然保护区、重要渔业水域、海滨风景名胜区和其他需要特别保护的区域，不得新建排污口。
这样的冲突，也许短期之内没有终极的解决之道。
从经济学理论上，或者可以通过排放者向渔民支付一定费用，打成某种程度的均衡；从环境法制上看，长江中下游的环境容量是否达到了极限，新的大规模排放的工业的审批，需要规划环评，也需要公众的参与和权衡。
目前这种禁止报道，禁止诉讼，禁止抗争的做法，显然只是推迟和掩盖了冲突。
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