*事件背后军方阴谋*
台湾立法院国防及外交委员会委员、民进党立委蔡煌琅召开记者会表示，杨念祖涉及抄袭的文章在6年前就已经发表，为何此时才被揭发出来？这背后一定有来自于军方的阴谋。
他说：“对马英九执政5年来，弱化国防，剥夺军系的权利，引起这些反改革、保守威权势力的反扑，他们借由拉下杨念祖，目的是打击马英九，要求马英九向军系屈服。”
蔡煌琅委员还指出，总统府目前和军方的互动，显然非常紧张，已经危及军队的稳定和国家的安全，希望马英九能召开国安会议处理这项危机。
民进党立委蔡煌琅(美国之音张永泰拍摄)
民进党立委蔡煌琅(美国之音张永泰拍摄)
杨念祖是马英九任内提名的首位国防部文人副部长，前任国防部长高华柱因为一位军人被虐待死亡案件下台之后，于8月1号接任了国防部长。
*无关军方派系斗争*
同样是立法院国防及外交委员会委员、国民党立委林郁方表示，有些人想象力太丰富了，杨念祖的辞职是个人因素，也和军方的派系斗争无关。
他说：“现在坦白讲，军队里没什么派系啦，尤其高华柱强势领导之后，哪有什么派系。这纯粹是杨念祖认为，这个议题(抄袭事件)，在野党不会放过他，名嘴们也不会放过他，他觉得如果待下去的话，他会持续的受伤。”
国民党立委林郁方(美国之音张永泰拍摄)
国民党立委林郁方(美国之音张永泰拍摄)
林郁方委员还说，杨念祖接任国防部长之后，就出现了倦勤之意，选择辞职，对于他个人、国防部，乃至国家都是好事。
民进党立委黄伟哲表示，杨念祖和美国的军方及外交界关系非常好，和美国的学界也常有往来，可以合理的推断，这个事件也可能涉及国际阴谋。
国民党立委丁守中表示，杨念祖涉及的文章抄袭事件是诚实信用的问题，辞职只是为他自己个人的行为负责，应该和所谓的阴谋论无关。
*抄袭论文来自美国*
杨念祖现年58岁，担任军职之前，在学术界相当活妖，曾经是高等政策研究中心的秘书长，研究的主题包括，美中台关系、两岸军事互信机制、中国人民解放军和区域安全等。
至于杨念祖涉及抄袭的论文，来自于美国军事专家费学礼(Richard Fisher)所撰写的文章，并由中国[国际展望杂志]翻译出版。
根据台湾半官方的[中央社]报道，费学礼接受访问表示，他和杨念祖是多年的好友，并不介意文章被引用，并认为杨念祖为此事下台，是很蠢的理由。费学礼深信杨念祖能为台湾的安全做出贡献，他说，杨念祖在此时辞职对台湾是弊大于利。
台湾总统马英九以党主席的身份在国民党中常会表示，和行政院长江宜桦讨论之后，任命参谋总长严明接任国防部长，希望能稳定军心，稳定士气。
在野的民进党主席苏贞昌呼吁，马英九总统应该负起三军统帅的责任，改革军队长久以来的问题，并要求任命文人国防部长，以符合民主常态，持续军队的改革动能。
