2014年3月至4月台湾“太阳花学运”期间，部分学运人士闯入并占领行政院，后因此被起诉。时隔两年，5月23日，台湾行政院发言人童振源宣布，行政院长林全在20日上任后批出的第二份公文，就是撤回对126名太阳花学运人士的起诉。
童振源引述林全表示，太阳花学运是“政治事件”，而非单纯的法律事件，应在“多一点和谐、少一点冲突”的原则下尽量从宽处理， 因此决定撤告。
他还引述林全表示，太阳花学运诉求已普遍成为社会共识，立法院也依诉求对两岸协议监督条例进行立法，凸显太阳花学运的正当性与社会贡献。
图为2014年3月20日，学生和公民团体占领立法院议场。摄：Ashley Pon/Getty
立法院长苏嘉全于23日表示，社会对太阳花运动的诉求持正面看法，对于行政院的做法，立法院“基本上还是尊重”的。总统府发言人黄重谚也于24日表示，太阳花学运是深化台湾民主的重要里程碑，支持行政院撤回对太阳花学运人士的控诉。
过去政府不做，就由现在政府来做。—— 民进党立法院党团书记长陈亭妃
2014年3月23日晚上7时左右，部分反服贸群众和学生爬入行政院，在行政院正门前广场静坐抗议。社运组织“黑色岛国青年阵线”随后在 Facebook 宣布占领行政院；台湾清华大学研究所学生魏扬宣称是占领行动的总指挥。
警方在24日凌晨展开强制驱离行动，过程中与学运人士发生肢体冲突；警方还开动镇暴水车，以水柱驱离学运人士。后经行政院评估，驱离过程中约有107人受伤，包括学生与警察，另学运人士闯入行政院破坏公物，造成约300万新台币损失。
台北地检署于2015年侦办此案，依侵入建筑物罪起诉魏扬等93名被告；部分人被指窃取行政院内的浓烟逃生袋、以手机拍下行政院公文、对警员呛声、破坏行政院的门等，依窃盗、妨害公务、毁损等罪名被起诉。
对于今次相关学运人士被撤诉，国民党文传会副主委王鸿薇于23日表示，行政院以政治方式解决司法案件，是纵容民众入侵公署、损害公物，认同群众以违法手段达到政治目的，国民党对此深表遗憾。
王鸿薇还表示，新政府在第一个上班日，即以政治考量撤告，未经法律层面的广泛讨论就草率决定，是不负责任的做法，并指：“如果行政公署都可以攻占，那么新政府可下令各机关不必再设置驻卫警了。”
民进党立法院党团书记长陈亭妃则表示，太阳花学运是民众对自己国家的未来发声，但（当届）政府不听，所以民众才走上街头。时代力量立法院党团总召徐永明也表示，撤诉是正面的事情，希望林全进一步追究当时警察殴打学生跟民众的责任。
率领占领行政院行动的魏扬表示，撤诉代表政府肯定公民不服从的权利。太阳花学运领袖林飞帆也在 Facebook 表示，撤诉是很好的开始，而他更期待的是学运的诉求能真正落实于新政府施政中，包括两岸协议监督条例的六大主张，以及公民参与宪政改革的实质推动。
曾参与太阳花学运的时代力量执行党主席黄国昌也表示，相关决定代表林全承认学运对台湾民主的重要贡献，个人给予林全“相当高度的评价”。
